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chi-biotech 細菌/真菌重測序

  


  


  細菌/真菌基因組重測序主要是針對有參考基因組的物種進行測序,用于檢測基因序列間的位點差異和結構變異,即檢測發現單核苷酸多態性位點( SNP)、插入( Insertion)、缺失( Deletion)等變異類型。




技術路線



技術參數



樣本類型:基因組DNA,樣本總量≥2 μg,樣本濃度:≥50 ng/μL
測序策略:HiSeq PE150,推薦測序深度:100X
項目周期:30個工作日



生物信息分析內容



細菌重測序

真菌重測序

1. 數據質控

2. 初級組裝

3. 與參考基因組比對

4. SNP、Indel、SV檢測及注釋

5. 物種進化分析(系統發育樹、Ka/Ks分析)


1. 數據質控

2. 與參考基因組比對

3. SNP、Indel、SV檢測及注釋

4. 物種進化分析(系統發育樹、Ka/Ks分析)








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